种植百科国际权威科学机构对于转基因食品的评价是“至少跟同类传统食品一样安全”，或者说“其食用风险并不比传统食品更大”。事实上，如果我们考虑其某些特性及监管因素，会发现转基因食品甚至比“传统食品”更安全：抗虫转基因技术减少了农药残留，显然提高了食品的安全性；转基因食品接受了更加严格的监管和层层检测，大大减少了食品生产中的不规范行为，这也提高了其安全性。
我们还可以从另外一个角度分析转基因食品的安全性。传统育种种出来的玉米，经常被玉米螟虫啃食，而被咬过的玉米在下雨后，很容易发生霉变，从而产生强致癌物黄曲霉素以及致畸的伏马毒素。黄曲霉素的毒性是氯化钾的5倍，会造成严重的健康问题。转基因抗虫玉米能够防止被虫咬，也就减少了发霉带来的致癌问题。
与杂交育种、诱变育种等相比，转基因育种更为精准、过程更可控、性状可预期。杂交育种可能一次导入的就是上千上万个基因，形成数以百万计的基因组合；辐射诱变育种一次可能导致成百上千个基因突变，既有我们需要的突变，也有我们不需要的突变。转基因育种一次只转入一个或几个基因，转入的是什么基因，插入的位置在哪，后代是什么情况，清清楚楚。
也有人说，“杂交育种只是同种植物之间的交流，而转基因植物导入的是跨物种的外源基因，更危险”。实际上，如果它们成为食物进入人体，人的消化系统根本不会管这些基因从哪来，都“一视同仁”地进行消化。
需要提及的是，“纯天然”或“自然食品”只是一个相对的概念，毕竟人类的食物都是经过几百甚至上千年的育种、选择而来的，但即使是人类上千年“挑”出来的食品，也不一定是安全的。很多人爱吃蕨根粉，蕨根粉源自蕨菜，蕨菜也是南方人很爱吃的一道野菜，但蕨菜中的原蕨苷具有致癌性；烧烤、腌制食品会增加致癌风险。所以，并不是祖先“吃了上千年”的是就是安全的。
本文内容来自《思维上的困惑：公众关心的转基因问题》
